Hola Libardo,
Te recomiendo que hagas el ejercicio primero en un ambiente de pruebas.
Al eliminar una solución administrada, eliminas los componentes que contiene esta solución de tu ambiente, en tu caso tienes 02 entidades personalizadas y 02 nativas, las nativas se mantendrían en su versión anterior.
Pruebalo en un ambiente de pruebas y seguidamente en tu entorno de producción.
Haznos saber, como te fue.
[MVP]-Microsoft Dynamics CRM | My blog:
http://jimmylarrauri.blogspot.com | My twitter:
http://twitter.com/jimlarrauri